El Instituto de Investigación y Formación Agraria y Pesquera de la Junta de Andalucía (IFAPA) ha liderado los trabajos que han permitido organizar el genoma del lenguado en 21 cromosomas, mediante la combinación de secuencias de ADN muy largas y marcadores genéticos. Para conocer más de cerca este proyecto hemos hablado con Manuel Manchado, quien ha liderado esta iniciativa y nos ha concedido una entrevista para nuestra sección 'En nombre propio'...
El Instituto de Investigación y Formación Agraria y Pesquera (IFAPA) ha liderado los trabajos que han permitido organizar el genoma del lenguado en 21 cromosomas. ¿Cómo y cuándo nació la idea de llevar a cabo este proyecto? ¿Cuántas personas han participado?
IFAPA lleva investigando en genética de lenguado para su aplicación en la producción acuícola más de 15 años. Durante todo este período, las tecnologías de análisis genético han evolucionado enormemente permitiendo alcanzar una enorme precisión a nivel molecular. Este desarrollo nos ha permitido plantear retos cada vez más complejos como el descifrado del genoma para lo cual que requiere de equipos multidisciplinares muy especializados.
Esta idea surge como una evolución natural durante los proyectos de investigación y como parte de una tesis doctoral para mejorar la precisión de los planes de selección genética. De esta forma, se ha consiguiódo aunar los esfuerzos de bioinformáticos, genetistas y expertos en acuicultura tanto nacionales como internacionales de diferentes instituciones para generar un mapa físico de los 21 cromosomas del lenguado y desarrollar herramientas y marcadores con un impacto en la producción y que generarán varias publicaciones científicas algunas aún en revisión. De esta forma, en estos trabajos han colaborado investigadores de IFAPA, Universidad de Las Palmas de Gran Canaria, Universidad de Málaga, Instituto Nacional de Toxicología y Ciencias Forenses de Sta. Cruz de Tenerife, CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation de Barcelona, Life Sequencing de Valencia y el Instituto ISEM de la Universidad de Montpellier.
¿Cuáles son los principales objetivos del proyecto?
Este trabajo y otros relacionados sobre el genoma que se publicarán en breve son parte de la tesis doctoral de Israel Guerrero y surgen a partir de un proyecto FEDER financiado por IFAPA (PR.AVA.AVA201601.9) cuyo objetivo era el desarrollo de nuevas herramientas de análisis genómico que impulsen la acuicultura del lenguado (solealgae). De esta forma, conseguimos abundante información genómica y marcadores moleculares generadas a partir de varis tecnologías de secuenciación masiva. Esta información fuer esencial para un ensamblaje inicial de genoma y que posteriormente se desarrolla en un proyecto coordinado financiado por la Agencia estatal de investigación para el "Estudio genómico y bioinformático de los factores que determinan la morfología y sus alteraciones en dorada y lenguado senegalés (Morfogen)" RTA2017-00054-C03. En dicho proyecto, mediante un amplio equipo multidisciplinar se aborda los estudios in silico de genoma y transcriptoma en lenguado y su aplicación a la mejora del crecimiento y su morfología.
¿Qué tecnologías se han llevado a cabo para lograr este proyecto"/images/showid/4316788.jpg" alt="Lenguados 2 (Foto Ifapa)">
¿Qué características biológicas tiene este animal"pseudocopula" basada en la sincronización en la liberación de gametos por proximidad.
¿Qué beneficios tiene su consumo para la salud"/images/showid/4316789.jpg" alt="Lenguados 7 (Foto Ifapa)">
En la actualidad, ¿cómo es la colaboración entre investigación pública y privada en lo que respecta a transferencia tecnológica?
Desde IFAPA mantenemos una estrecha colaboración con las empresas productoras de lenguado y dorada. A través de los planes de selección genética y estudios en diferentes campos desde la nutrición, inmunología o tecnología de cultivo investigamos para avanzar con los modelos productivos que actualmente de desarrollan en Andalucía para aumentar su sostenibilidad e integración ambiental. De esta forma, tenemos contratos y convenios con varias empresas y colaboramos en proyectos de convocatorias nacionales e internacionales que son claves para captar y desarrollar nuevas tecnologías, así como para introducir la innovación dentro de las empresas como elemento de competitividad a medio-largo plazo.
Por último, Ifapa viene desarrollando trabajos e investigaciones en el campo de la acuicultura desde hace 20 años. ¿Cómo han ayudado estas investigaciones a la industria? ¿Cuál es el siguiente proyecto?
IFAPA ha sido clave para impulsar el cultivo del lenguado gracias a un gran desarrollo tecnológico desarrollado en la última década y reconocido a nivel europeo. Hoy aún seguimos trabajando y mejorando el ciclo de producción en colaboración con las empresas porque consideramos que es un nicho de gran potencial económico para Andalucía. Por otro lado, estamos trabajando en nuevas tecnologías de producción de moluscos de alto valor comercial como la almeja y la zamburiña así como en introducción de nuevos productos basados en modelos ecosostenibles como es el cereal marino. Toda esta actividad es en colaboración con empresas que pueden aplicar la tecnología in situ. Son muchos proyectos e ideas que se están desarrollando de novo pero podemos citar el proyecto europeo Bestbrood como una paso más para investigar la reproducción del lenguado para entender mejor y controlar su cortejo e incrementar la producción de gametos y apoyar así una acuicultura más inteligente, más competitiva y más sostenible.
EN NOMBRE PROPIO
Un libro… Steve Jobs, De Walter Isaacson.
Un color... El azul del océano
Un animal... El perro, por su fidelidad y amistad.
Una afición… La música de plectro
Un deseo... Una oportunidad para los jóvenes investigadores
Un día de la semana... El viernes
Una estación del año… La primavera
Una comida.... Arroz con caracoles
Un destino.... Meteora en la Tesalia griega
Un refrán...Si no encuentras tu camino, háztelo
